MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella woodyi ATCC 51908 chromosome

Total Repeats: 108728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010506	TAAGG	2	10	2	11	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010506	A	6	6	14	19	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010506	CAA	2	6	54	59	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010506	ATT	2	6	92	97	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010506	GCC	2	6	193	198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_010506	GATC	2	8	206	213	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_010506	TAA	2	6	223	228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010506	T	6	6	244	249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010506	AGG	2	6	255	260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010506	ATCT	2	8	304	311	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010506	TTA	2	6	322	327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010506	CTTT	2	8	365	372	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010506	GCA	2	6	414	419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170724371
14	NC_010506	CAG	2	6	454	459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170724371
15	NC_010506	GATG	2	8	492	499	25 %	25 %	50 %	0 %	170724371
16	NC_010506	AC	3	6	503	508	50 %	0 %	0 %	50 %	170724371
17	NC_010506	ATC	2	6	568	573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724371
18	NC_010506	GGT	2	6	675	680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724371
19	NC_010506	A	6	6	707	712	100 %	0 %	0 %	0 %	170724371
20	NC_010506	CCTA	2	8	781	788	25 %	25 %	0 %	50 %	170724371
21	NC_010506	GGC	2	6	834	839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170724371
22	NC_010506	GGT	2	6	865	870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724371
23	NC_010506	TTA	2	6	922	927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170724371
24	NC_010506	CAT	2	6	945	950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724371
25	NC_010506	TA	3	6	977	982	50 %	50 %	0 %	0 %	170724371
26	NC_010506	AAT	2	6	1027	1032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170724371
27	NC_010506	TAC	2	6	1054	1059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724371
28	NC_010506	GAT	2	6	1084	1089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724371
29	NC_010506	TAA	2	6	1104	1109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170724371
30	NC_010506	AGAT	2	8	1110	1117	50 %	25 %	25 %	0 %	170724371
31	NC_010506	ATC	2	6	1163	1168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724371
32	NC_010506	ATC	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724371
33	NC_010506	ACC	2	6	1266	1271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170724371
34	NC_010506	AG	3	6	1314	1319	50 %	0 %	50 %	0 %	170724371
35	NC_010506	T	6	6	1348	1353	0 %	100 %	0 %	0 %	170724371
36	NC_010506	ATA	2	6	1511	1516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170724371
37	NC_010506	TAC	2	6	1537	1542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724371
38	NC_010506	CGT	2	6	1573	1578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170724371
39	NC_010506	TGG	2	6	1668	1673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724371
40	NC_010506	GAA	2	6	1726	1731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170724371
41	NC_010506	AGA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170724371
42	NC_010506	TGA	2	6	1803	1808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724372
43	NC_010506	GA	3	6	1868	1873	50 %	0 %	50 %	0 %	170724372
44	NC_010506	TAG	2	6	1905	1910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724372
45	NC_010506	AGTG	2	8	1912	1919	25 %	25 %	50 %	0 %	170724372
46	NC_010506	TCAC	2	8	1921	1928	25 %	25 %	0 %	50 %	170724372
47	NC_010506	TTGG	2	8	1961	1968	0 %	50 %	50 %	0 %	170724372
48	NC_010506	CAC	2	6	2005	2010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170724372
49	NC_010506	GAA	2	6	2020	2025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170724372
50	NC_010506	CGG	2	6	2139	2144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170724372
51	NC_010506	TTG	2	6	2276	2281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170724372
52	NC_010506	TGC	2	6	2301	2306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170724372
53	NC_010506	CGAC	2	8	2316	2323	25 %	0 %	25 %	50 %	170724372
54	NC_010506	CAGA	2	8	2347	2354	50 %	0 %	25 %	25 %	170724372
55	NC_010506	GTT	2	6	2402	2407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170724372
56	NC_010506	CGA	2	6	2478	2483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170724372
57	NC_010506	TCG	2	6	2536	2541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170724372
58	NC_010506	GCG	2	6	2556	2561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170724372
59	NC_010506	ATC	2	6	2586	2591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724372
60	NC_010506	ACT	2	6	2602	2607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724372
61	NC_010506	GTG	2	6	2640	2645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724372
62	NC_010506	TTAA	2	8	2669	2676	50 %	50 %	0 %	0 %	170724372
63	NC_010506	AGG	3	9	2700	2708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170724372
64	NC_010506	GGA	2	6	2710	2715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170724372
65	NC_010506	GAT	2	6	2804	2809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724372
66	NC_010506	TTGA	2	8	2846	2853	25 %	50 %	25 %	0 %	170724372
67	NC_010506	TATG	2	8	2875	2882	25 %	50 %	25 %	0 %	170724372
68	NC_010506	ATT	2	6	2952	2957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010506	T	7	7	2963	2969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010506	TGA	2	6	3004	3009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010506	TCT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010506	CTTT	2	8	3079	3086	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010506	ATCT	2	8	3290	3297	25 %	50 %	0 %	25 %	170724373
74	NC_010506	GATAA	2	10	3424	3433	60 %	20 %	20 %	0 %	170724373
75	NC_010506	AG	3	6	3483	3488	50 %	0 %	50 %	0 %	170724373
76	NC_010506	AAC	2	6	3728	3733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170724373
77	NC_010506	GA	3	6	3843	3848	50 %	0 %	50 %	0 %	170724373
78	NC_010506	GCG	2	6	3853	3858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170724373
79	NC_010506	ACA	2	6	3996	4001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170724373
80	NC_010506	TGG	2	6	4025	4030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724373
81	NC_010506	TTG	2	6	4072	4077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170724373
82	NC_010506	ACCAC	2	10	4150	4159	40 %	0 %	0 %	60 %	170724373
83	NC_010506	GT	3	6	4188	4193	0 %	50 %	50 %	0 %	170724373
84	NC_010506	CGA	2	6	4211	4216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170724373
85	NC_010506	GA	3	6	4215	4220	50 %	0 %	50 %	0 %	170724373
86	NC_010506	ATA	2	6	4221	4226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170724373
87	NC_010506	TTC	2	6	4246	4251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170724374
88	NC_010506	CGA	2	6	4318	4323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170724374
89	NC_010506	CAC	2	6	4337	4342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170724374
90	NC_010506	ACG	2	6	4398	4403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170724374
91	NC_010506	ATC	2	6	4406	4411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724374
92	NC_010506	GAT	2	6	4445	4450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724374
93	NC_010506	TGG	2	6	4528	4533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724374
94	NC_010506	GAT	2	6	4541	4546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724374
95	NC_010506	TGG	2	6	4564	4569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724374
96	NC_010506	GGTGTT	2	12	4577	4588	0 %	50 %	50 %	0 %	170724374
97	NC_010506	TCG	2	6	4630	4635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170724374
98	NC_010506	CAA	2	6	4707	4712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170724374
99	NC_010506	CT	3	6	4805	4810	0 %	50 %	0 %	50 %	170724374
100	NC_010506	TGA	2	6	4843	4848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724374
101	NC_010506	TCT	2	6	5025	5030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170724374
102	NC_010506	CAA	2	6	5038	5043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170724374
103	NC_010506	TGG	2	6	5059	5064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724374
104	NC_010506	GAT	2	6	5165	5170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724374
105	NC_010506	AAGCT	2	10	5328	5337	40 %	20 %	20 %	20 %	170724374
106	NC_010506	GCCCGT	2	12	5363	5374	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	170724374
107	NC_010506	GCG	2	6	5378	5383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170724374
108	NC_010506	TCG	2	6	5404	5409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170724374
109	NC_010506	CTG	2	6	5508	5513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170724374
110	NC_010506	TTA	2	6	5637	5642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170724374
111	NC_010506	TGA	2	6	5668	5673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724374
112	NC_010506	CTT	3	9	5764	5772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170724374
113	NC_010506	TA	3	6	5829	5834	50 %	50 %	0 %	0 %	170724374
114	NC_010506	GAA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170724374
115	NC_010506	GAT	2	6	5870	5875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724374
116	NC_010506	CTAA	2	8	5894	5901	50 %	25 %	0 %	25 %	170724374
117	NC_010506	TGG	2	6	5914	5919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724374
118	NC_010506	ATCC	2	8	5924	5931	25 %	25 %	0 %	50 %	170724374
119	NC_010506	TGA	2	6	6091	6096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724374
120	NC_010506	GTG	2	6	6112	6117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724374
121	NC_010506	TGG	2	6	6154	6159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724374
122	NC_010506	TACC	2	8	6206	6213	25 %	25 %	0 %	50 %	170724374
123	NC_010506	CTT	2	6	6250	6255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170724374
124	NC_010506	TGA	2	6	6294	6299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724374
125	NC_010506	TTGA	2	8	6326	6333	25 %	50 %	25 %	0 %	170724374
126	NC_010506	GGT	2	6	6338	6343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724374
127	NC_010506	GTG	2	6	6354	6359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724374
128	NC_010506	AGG	2	6	6369	6374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170724374
129	NC_010506	AATG	2	8	6406	6413	50 %	25 %	25 %	0 %	170724374
130	NC_010506	TA	3	6	6429	6434	50 %	50 %	0 %	0 %	170724374
131	NC_010506	CGT	2	6	6590	6595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170724374
132	NC_010506	AGA	2	6	6698	6703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010506	T	6	6	6724	6729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010506	AGG	2	6	6820	6825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010506	GTA	2	6	6844	6849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010506	TGTA	2	8	7018	7025	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010506	GCA	2	6	7063	7068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010506	TTG	2	6	7130	7135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170724375
139	NC_010506	TTCT	2	8	7180	7187	0 %	75 %	0 %	25 %	170724375
140	NC_010506	TAA	2	6	7212	7217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170724375
141	NC_010506	CAG	2	6	7284	7289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170724375
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143	NC_010506	CAT	2	6	7329	7334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724375
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146	NC_010506	CAT	2	6	7389	7394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724375
147	NC_010506	GCTA	2	8	7474	7481	25 %	25 %	25 %	25 %	170724375
148	NC_010506	TGG	2	6	7554	7559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170724375
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152	NC_010506	AGT	2	6	7883	7888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724375
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155	NC_010506	A	6	6	8091	8096	100 %	0 %	0 %	0 %	170724375
156	NC_010506	TGT	2	6	8215	8220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170724375
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173	NC_010506	TTG	2	6	9100	9105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
174	NC_010506	ATA	2	6	9157	9162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_010506	AT	3	6	14425	14430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_010506	A	7	7	14494	14500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_010506	CT	3	6	14545	14550	0 %	50 %	0 %	50 %	170724381
252	NC_010506	A	6	6	14587	14592	100 %	0 %	0 %	0 %	170724381
253	NC_010506	AG	3	6	14637	14642	50 %	0 %	50 %	0 %	170724381
254	NC_010506	TGT	2	6	14675	14680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170724381
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264	NC_010506	ATG	2	6	15164	15169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724381
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267	NC_010506	TTG	2	6	15292	15297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170724381
268	NC_010506	GGATGA	2	12	15447	15458	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	170724381
269	NC_010506	GATG	2	8	15474	15481	25 %	25 %	50 %	0 %	170724381
270	NC_010506	TACC	2	8	15507	15514	25 %	25 %	0 %	50 %	170724381
271	NC_010506	A	8	8	15536	15543	100 %	0 %	0 %	0 %	170724381
272	NC_010506	TCA	2	6	15658	15663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724382
273	NC_010506	CCATCA	2	12	15668	15679	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	170724382
274	NC_010506	GAA	2	6	15687	15692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170724382
275	NC_010506	GCA	2	6	15751	15756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170724382
276	NC_010506	CCA	2	6	15821	15826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170724382
277	NC_010506	CTG	2	6	15835	15840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170724382
278	NC_010506	GCT	2	6	15898	15903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170724382
279	NC_010506	CAG	2	6	15968	15973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170724382
280	NC_010506	CAA	2	6	16139	16144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170724382
281	NC_010506	ATT	2	6	16158	16163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170724382
282	NC_010506	TGC	2	6	16191	16196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170724382
283	NC_010506	CTG	2	6	16217	16222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170724382
284	NC_010506	GC	3	6	16389	16394	0 %	0 %	50 %	50 %	170724382
285	NC_010506	TCA	2	6	16448	16453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724382
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287	NC_010506	GCT	2	6	16553	16558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170724382
288	NC_010506	GTT	2	6	16571	16576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170724382
289	NC_010506	GTTT	2	8	16621	16628	0 %	75 %	25 %	0 %	170724382
290	NC_010506	GAA	3	9	16641	16649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170724382
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292	NC_010506	GTA	2	6	16748	16753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724382
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297	NC_010506	TG	3	6	17154	17159	0 %	50 %	50 %	0 %	170724382
298	NC_010506	CTTG	2	8	17181	17188	0 %	50 %	25 %	25 %	170724382
299	NC_010506	CAA	2	6	17273	17278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170724382
300	NC_010506	TGA	2	6	17287	17292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170724382
301	NC_010506	AGCCC	2	10	17358	17367	20 %	0 %	20 %	60 %	170724382
302	NC_010506	GGC	2	6	17370	17375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170724382
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305	NC_010506	TA	3	6	17645	17650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
306	NC_010506	ATA	2	6	17693	17698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170724383
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313	NC_010506	CTA	2	6	18562	18567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
314	NC_010506	AACC	2	8	18586	18593	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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317	NC_010506	T	6	6	18686	18691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
318	NC_010506	TCA	2	6	18695	18700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
319	NC_010506	TTA	2	6	18716	18721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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338	NC_010506	TAAA	2	8	19528	19535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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341	NC_010506	A	6	6	19641	19646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
342	NC_010506	A	6	6	19719	19724	100 %	0 %	0 %	0 %	170724385
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383	NC_010506	T	6	6	22830	22835	0 %	100 %	0 %	0 %	170724385
384	NC_010506	TTC	2	6	22845	22850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170724385
385	NC_010506	AGCTGA	2	12	22865	22876	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	170724385
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387	NC_010506	TTA	3	9	22934	22942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
388	NC_010506	CTTT	2	8	22957	22964	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
389	NC_010506	ACCTG	2	10	23014	23023	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
390	NC_010506	TTAT	2	8	23088	23095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
391	NC_010506	AAAACA	2	12	23116	23127	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
392	NC_010506	GTA	2	6	23130	23135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
393	NC_010506	AATG	2	8	23144	23151	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
394	NC_010506	TTGAG	2	10	23152	23161	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
395	NC_010506	A	6	6	23177	23182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
396	NC_010506	GGAT	2	8	23183	23190	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
397	NC_010506	TGA	2	6	23207	23212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
398	NC_010506	CAT	2	6	23299	23304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170724386
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403	NC_010506	A	7	7	23591	23597	100 %	0 %	0 %	0 %	170724386
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